三都澳的开发面临多方面的挑战，主要包括以下几点：
地理位置和交通：
三都澳位于偏远地区，交通不便，这增加了开发的难度和成本。
自然条件：
该地区地理条件复杂，可能对开发和建设构成障碍。
环境保护：
三都澳拥有丰富的自然资源，自然环境保护意识和相关政策限制也是影响开发的重要因素。
市场和经济发展：
周边人口较少，市场和经济发展程度较低，这减少了开发商的兴趣和投资潜力。
战略和安全考虑：
三都澳港的地理位置使其在军事和战略上存在一定风险，由于其门户正对着台湾海峡，任何军事行动都可能被敌方察觉和干扰。
历史原因：
过去半个世纪中，三都澳的开发长期处于不被重视的状态，直到近年来才逐渐被提上开发日程。
综上所述，三都澳的开发受到多方面因素的影响，包括地理、经济、环境和战略等方面。随着未来经济和交通基础设施的改善，以及对旅游资源的开发，三都澳有潜力成为旅游点和发展区，并带动当地经济繁荣