如果单位丢失了您的档案，您可以采取以下步骤来处理：
上报主管部门
一旦发现档案丢失，您应立即向您的上级主管部门报告。这是为了启动必要的调查和补救程序，防止事态进一步扩大。
开展内部调查
单位需要组织专项调查，明确档案丢失的原因。例如，档案是在移交过程中丢失，还是因管理混乱或个人失误遗失？调查结果将为责任认定和补救措施提供依据。
发布遗失声明
通过适当渠道（如登报声明）告知档案遗失情况，以保护个人档案安全并避免档案被不当利用。
通知当事人
及时通知档案所有人，说明情况，并告知对方可采取的补救措施，并给予相应协助。
补办相关证明材料
协助当事人补办涉及的各类材料，例如：
学历证明：向学校申请开具毕业证明。
工作经历证明：根据以往的劳动合同、工资记录补齐。
社会保险记录：向社保部门申请查询和打印相关缴费记录。
档案重建与整合
在补办关键证明材料后，单位应尽可能根据当事人提供的历史资料、复印件以及相关部门的证明，帮助其完成档案的重建工作。对于难以重新获取的文件，可采取佐证材料替代。
法律途径
如果单位拒绝补办个人档案，您可以向法院起诉用人单位，要求其赔偿因此给个人造成的经济损失。法律依据：《档案法》第四十八条和《中华人民共和国户口登记条例》第十八条。
档案保管
补办完成的档案应放在具有档案管理权限的地方进行保管，以确保其合法有效。
通过以上步骤，您可以尽可能地减少档案丢失带来的影响，并依法维护自己的权益。