申请日本经营管理签证的主要花费包括：
注册资金：
最低500万日元（约合人民币25万元左右）。
办公室租金：
东京地区约为30-50万日元/月（约合人民币1.5-2.5万元/月）。
员工工资：
至少25万日元/月（约合人民币1.25万元/月）。
社保年金：
大约6万日元/月（约合人民币0.3万元/月）。
税费：
包括法人税、个人所得税、社会保险等，具体数额根据公司盈利情况和员工人数而定。
税理士费用：
处理公司财务和税务问题，费用大约在30-40万日元/年（约合人民币1.5-2万元/年）。
其他杂费：
包括日常办公运营、办公用品等。
综合以上费用，假设没有员工，只有申请人自己作为员工，并且办公室位于东京，一年的总花费大约在100万人民币左右。这只是一个粗略的估计，实际花费会根据具体位置、公司规模、员工数量等因素有所不同。
请注意，以上信息基于2023年及2024年的数据，政策可能会有变动，建议在准备申请前咨询最新的移民政策和费用信息