北京货车通行证的办理流程如下：
提交申请
由车主所在单位或者使用单位提交书面申请，无单位的由当地社区居委签章证明。
准备材料
行驶证原件及复印件。
环保合格标志或当地市级环保部门出具的车辆尾气检验合格凭证。
机动车交通事故责任强制保险标志。
机动车检验合格标志。
驾驶人的驾驶证、身份证（或户口本）。
如有特殊需要，如重大节假日或活动，需提供相关证明材料。
办理方式
可以通过交管12123软件在线办理，进入业务中心，选择城市货车通行码申领，按提示填写信息并提交。
也可以到市公安交通管理局秩序处办证窗口现场办理，携带上述材料。
费用
通常需要支付一定的工本费，用于制作证件本身。
审批与制证
办证窗口核定行驶区域、行驶线路等内容后报批。
按照批准的事项制发相应的通行证。
注意事项
对于核发号牌的国三排放标准柴油载货汽车，有特定的禁行规定，如五环路以内道路禁止载货汽车通行等。
办理通行证的费用和具体流程可能会随政策更新而变化，请以最新官方信息为准。
请根据您的具体情况选择合适的办理方式，并关注最新的政策和规定。