当公司老板跑路时，员工可以采取以下措施来维护自己的权益：
向劳动部门申请仲裁
员工可以向当地劳动监察部门或劳动仲裁委员会申请仲裁，并提供能证明劳动关系的证据，如工资条、打卡记录、考勤簿等。
向法院申请资产保护及清算拍卖
如果公司进入破产程序，员工不仅可以追回工资，还可以依法领取经济补偿金。
搜集证据
员工应搜集所有能证明劳动关系和工资拖欠的证据，如工资条、工作往来信息、证人证言、录音等。
保护公司生产资料
员工应保护好厂里的设备等相关生产资料，等待政府部门查封，这些设备拍卖所得可能会用来发放被拖欠的工资。
向公安机关报案
如果老板的行为构成拒不支付劳动报酬罪，员工可以向公安机关报案。
参与破产清算程序
员工可以咨询专业律师，了解在破产清算程序中如何维护自己的权益，并积极参与相关程序。
法律途径
如果对劳动仲裁结果不满意，员工可以在规定时间内向法院起诉。
请记住，采取任何行动前，最好咨询专业律师以获得具体的法律建议和指导