港澳台通行证和签注是用于中国内地居民前往香港、澳门和台湾的旅行证件和审批流程。它们的主要区别如下：
通行证
港澳台通行证是由公安机关出入境管理部门签发给中国内地居民，用于因私往来香港、澳门和台湾地区的旅行证件。
通行证是出入境的身份凭证，通常有效期为五年。
签注
签注是附加在通行证上的注释，用以证明持有人有合法的理由和时间段前往港澳台。
签注会明确持有人此次访问的目的和允许的停留时间。
签注的有效期限可能包括3个月1次、3个月2次、1年1次、1年2次等不同类型。
要前往港澳台，必须同时拥有有效的港澳台通行证和相应的签注。签注是通行证上关于访问目的和合法停留期限的重要注释，两者缺一不可，并且需要获得内地公安部门的批准