处理汽车违章扣分的方法如下：
准备材料
携带身份证、驾驶证和行驶证到违章处理大厅办理。
确认违章信息
到车管所或交警大队查询违章记录，确认违章信息无误后接受处理。
填写相关表格
填写交通违法当事人自愿接受处罚确认书。
在违章处理窗口确认扣分信息，并签署相关文件。
缴纳罚款
持处罚决定书到指定的银行交罚款。罚款应在15日内缴纳，超过15天会有滞纳金。
保留票据
交完罚款后，保留好相关票据，以备后续查询或核对。
网上处理
可以通过交管系统的网上平台处理违章扣分，适用于扣分不超过三分的情况。
学习及考试
如果一个记分周期内扣分达到12分，驾驶人需要到指定地点进行学习和考试，考试合格后扣分才会清除。
避免滞纳金
注意缴纳罚款的时间，避免超过15天，以免产生滞纳金。
建议：
提前查询违章记录，合理安排处理时间，避免在年审前集中处理，以免造成不便。
如果扣分较多，可以考虑使用多个驾驶证进行扣分，以减少单个驾驶证的扣分压力。