日本投资经营管理签证的费用主要包括以下几部分：
首次签证费用
投资活动管理人、投资者/经营者、管理专业人才等类型的签证，首次签证费用为50,000日元（约合3000元人民币）。
注册资金
申请人在日本设立公司需要注册资金，最低为300万日元（约合18万元人民币），该资金必须属于注册企业所有，并可以自由支配。
办公室租赁费用 （仅适用于非实体店公司）：办公室租赁费用因地区和具体需求而异，一般每月至少需要2400元人民币以上，且办公室不能与住宅兼用。
法人税
即使公司在前两年内没有盈利，每年也需要支付5000元人民币的法人税。
其他费用
可能还需要支付律师费、注册公司费用等，具体金额因服务提供商和具体情况而异。
建议
初期投资：
建议初期投资约500万日元（约30万元人民币）并设立公司，以启动申请流程。
持续投入：根据公司的具体业务和营业收入，可能需要持续投入资金以维持公司的运营和签证的续签。
详细计划：在申请前，应详细规划公司的业务模式和预算，确保有足够的资金来支持公司的运营和签证的长期维持。
这些费用仅供参考，具体费用可能会因个人情况和选择的服务提供商而有所不同。建议在申请前仔细评估和准备，以确保顺利完成签证申请。