公积金贷款的扣款方式主要有以下几种：
从银行卡扣款
办理公积金贷款时，需要绑定一个银行卡，系统会在还款日自动从该银行卡中扣除应还款金额。
从公积金账户扣款 （公积金冲还贷）：
可以委托银行从个人公积金账户中提取余额来还贷款月供。
公积金冲还贷分为年冲和月冲两种方式。
年冲相当于每年办理一次部分提前还款，优先偿还公积金贷款本金，月还款需自行使用现金归还。
自动扣款机制
系统每天进行两次自动扣收，分别在早上8:30和下午17:00。
如果首次自动扣款失败，系统会在当天不同时间段再次尝试扣款。
扣款顺序与优先级
配偶双方共同申请贷款的，系统会优先从主贷人的还款账户中扣款，不足时从次贷人账户中扣款。
选择公积金对冲还款业务的，系统首先尝试从主贷人公积金账户扣款，不足时依次从次贷人公积金账户、主贷人银行卡、次贷人银行卡中扣款。
短信提醒
公积金中心会在还款日前三天发送还款提醒短信，还款日当天发送扣款成功或失败短信。
法律依据
《中华人民共和国民法典》第八条规定，民事主体从事民事活动不得违反法律，不得违背公序良俗。
请确保在还款日前确保账户中有足够的资金，以便顺利扣款。