重庆特病证的办理流程如下：
申报资料
填写《重庆市城乡居民合作医疗保险特殊疾病申请表》并提交至医保中心。
提供身份证复印件、代办人身份证复印件、近期1寸照片2张。
提供二级以上医院住院病历或三级医院门诊病历（含检查原始资料）。
集中体检
若无二级以上医院住院病历或三级医院门诊病历，则需填写申请表并申请参加集中体检，合格后方能办理《重庆市医疗保险特殊疾病资格证》。
诊断与领证
参保地医疗保险经办机构组织诊断医疗机构和申报人员集中开展检查诊断工作。
特病申办合格的，领取重庆市医疗保险特殊疾病资格证。
其他注意事项
携带既往病史资料至门诊医生就诊，符合条件的患者，由医生填写基本医疗保险特殊病种证明及门诊治疗审批表。
特殊病种审批表必须由二级以上定点医疗机构经治医师填写。
患者或家属携带病史资料、医保卡、身份证（未成年人持户口本）和1寸照片2张到医院相关病史资料到户籍所在地的社保所申请，领取并填写申请表，审批表到当地社保局审批并盖章。
线上申领
可以通过重庆市医疗保障局微信公众号进行线上申领，在服务中选择特病证展示及打印。
建议：
准备好所有必需的资料，确保资料的真实性和完整性。
提前咨询当地医保经办机构，了解具体病种的要求和申报流程。
选择合适的医院和科室进行诊断，确保诊断结果的准确性。