明祖陵之所以位于江苏省淮安市盱眙县，主要原因有以下几点：
家族迁徙历史：
朱元璋的家族原本是江苏省句容县人，因受不了元朝的压榨而迁徙至淮河边上，最终定居在现在的盱眙县。因此，朱元璋选择在此地建设祖陵，有落叶归根之意。
风水因素：
盱眙县内的杨家墩被认为是风水宝地，有道士预言此处“葬此可出天子”。朱元璋的祖父朱初一曾在此地放猪，并睡卧于一洼窝地带，后来朱元璋的父亲朱世珍在此安葬了朱初一。朱元璋认为这里的风水有利于皇族的繁荣，因此选择在此建陵。
纪念意义：
朱元璋在建立明朝后，为了耀祖光宗，派人四处寻找祖先的安葬地。最终在盱眙县找到了祖父的安葬地，并在此建设祖陵，追封并重葬其祖父朱初一、曾祖朱四九和高祖朱百六三代为“皇帝”。
地理位置：
明祖陵位于洪泽湖西岸，距离盱眙县城西北方向约20公里。这里地理位置特殊，被认为是“天龙”的龙头和“地龙”的龙身所在，形象生动，被认为是非常吉利的风水宝地。
综上所述，明祖陵之所以选择在盱眙，主要是因为其家族迁徙的历史背景、风水上的优势以及纪念意义等多方面因素的综合考虑。