驾驶证并证后的扣分方式如下：
合并后的记分周期：
驾驶证并证后，记分周期会合并计算。例如，如果你同时持有C1和D驾驶证，那么无论是驾驶C1还是D准驾车型的车辆，所有的记分都会合并到一本驾驶证上。
记满12分处理：
如果驾驶证并证后的记分达到12分，驾驶人需要参加道路交通安全法律、法规的学习和考试。考试合格后，记分会被清除，驾驶人可以重新领回机动车驾驶证。
扣分方式：
在并证后的驾驶证上，无论是驾驶哪种车型发生交通违法，扣分都会记在合并后的驾驶证上。如果驾驶其中一种车型违章，另一个准驾资质也会受到影响。
缴纳罚款：
确认违法信息后，需要到指定银行缴纳罚款。缴纳罚款后，违法信息会消除，扣分也会在下一个周期重新恢复。
总结：
驾驶证并证后，所有记分都会合并计算在一本驾驶证上，记满12分需要参加学习和考试，扣分按12分算，且无论驾驶哪种车型，扣分都会记在合并后的驾驶证上。缴纳罚款后，违法信息和扣分会被清除。