工程款的付款方式有多种，以下是一些主要的付款方式：
直接支付至承包人的指定账户
发包人将工程款支付至承包人的指定账户，无论是转账、现金汇款还是使用票据，这种方式能有效避免纠纷，并且任何一方都可以通过银行查询交易记录完成举证。
支付给承包人的有关人员
发包人有时会将工程款直接支付给实际施工人、承包人的财务人员、现场负责人或委托授权的其他人。
支付给特定的第三方
在履行合同过程中，发包人可能需要将一部分工程款支付给第三方，而承包人对此予以认可或应当认可的，这种方式同样具有法律效力。
按月结算
发包方会按照承包方每月完成的工程量进行支付，通常在月初进行预支，月终再根据实际完成的工程量进行结算。
分段结算
双方约定按照单项工程或单位工程的形象进度来划分不同的阶段进行结算，每个阶段工程完工后，发包方会进行相应的结算。
竣工后一次结算
对于工程规模较小、工期较短的项目，可以采用在施工过程中分次预支，待工程竣工后进行一次结算的方式。
双方约定的其他结算方式
发包方和承包方还可以根据具体工程的特点，选择其他的工程进度款支付方式和相应的结算时间。
预付款支付
项目启动时，发包人支付一定比例的预付款作为项目启动资金，预付款比例通常根据项目规模、合同类型及双方约定有所不同。
进度款支付
根据工程形象进度设定支付节点，如基础完成、主体结构封顶等，支付比例和方式应根据合同约定及实际资金状况灵活调整。
变更款支付
对于设计变更、工程量增减等带来的额外费用，应根据双方确认的变更通知单及新增工程量清单进行支付，确保每一笔费用都有据可依。
在选择工程款付款方式时，建议发包方和承包方充分沟通，明确合同条款，确保付款方式既符合双方利益，又能有效降低风险。