组合贷款中，公积金的扣除方式通常有以下几种：
直接代扣：
借款人委托贷款银行通过储蓄卡、存折等方式代扣偿还贷款本息。
公积金账户优先：
在还款时，系统首先尝试从借款人的公积金账户中扣除相应的金额来偿还公积金贷款部分。
配偶公积金账户：
如果借款人的公积金账户余额不足，系统会尝试从借款人配偶的公积金账户中扣除。
银行存款账户：
当借款人和配偶的公积金账户余额均不足以偿还贷款时，银行会从指定的还款储蓄账户中扣除。
对冲业务：
办理公积金对冲业务，将公积金余额用于偿还贷款，优先偿还公积金贷款部分。
年冲或月冲：
可以选择年冲或月冲方式，月冲是每月使用公积金余额冲抵月供，年冲则是每年使用公积金余额提前还款。
请注意，各地政策可能有所不同，具体操作方式建议咨询当地的公积金管理中心或贷款银行