当大棚内的秧苗被熏苗后，可以采取以下措施进行处理：
加强通风：
及时打开大棚的通风口，让新鲜空气进入，帮助降低氨气浓度，减轻熏苗症状。
浇水冲淡：
通过浇水可以稀释粪水中的氨氮浓度，减轻对秧苗的危害。
施肥调整：
未来在棚内施用有机肥时，确保充分腐熟后再施用，避免施用高浓度的氮肥，如尿素，特别是在石灰性土壤中。
叶面喷施：
可以喷施含有赤霉素、芸薹素等植物生长调节剂，增强植株的抗逆性。
补施微量元素：
如有缺素症状，如叶片弱小皱缩、发卷，可适量补充硼、钙等微量元素。
防治病害：
加强田间管理，及时拔除带病植株，防治蚜虫等传病媒介，并可适时喷药灭虫。
使用遮阳网：
在大棚内设置遮阳网，减少阳光直射，降低棚内温度。
使用脱毒种薯：
如果是生姜烤苗，选择脱毒的健康种薯，并在种植过程中注意防治病害。
请注意，处理熏苗的情况时要根据具体情况灵活调整措施，并且密切观察秧苗恢复情况。如果情况严重或无法自行处理，建议及时咨询农业技术人员或相关专业人士