当职工发生工伤事故并使用医保卡支付相关治疗费用时，应该按照以下步骤进行处理：
及时报告
向用人单位报告工伤事故，并说明已经使用医保卡支付了费用。
收集证明材料
准备医疗发票、费用清单、工伤认定决定书等相关证明材料。
申请报销
向当地的社会保险经办机构申请报销，或者如果未参保，则向用人单位申请报销。
退还款项
如果已经通过医保获得医疗费用补偿，应尽快前往社会保障事业经办机构办理医保报销资金的退还手续。
注意事项
工伤医疗费用应由工伤保险基金支付，不应使用医疗保险基金。
工伤保险不支付已经通过医保报销的医疗费用。
工伤保险的支付范围包括治疗工伤的医疗费用和康复费用，但需符合工伤保险的支付标准。
请确保遵循以上步骤，并与用人单位和当地社会保险经办机构保持沟通，以确保工伤赔偿流程顺利进行。