军婚婚检不合格的情况下，根据相关法律规定，军婚是强制婚检，如果婚检不合格，则不能结婚。以下是处理这种情况的建议：
沟通协商：
首先与女方进行沟通，了解不合格的具体原因，并共同探讨解决方案。
政策传达：
向女方传达军婚的特殊性以及不合格对军人家庭的影响。
医学干预：
对于因身体健康原因不合格的情况，可以采取医学干预措施，如治疗疾病或预防遗传性疾病。
政治审查：
若不合格是由于政治原因，需进行政治审查，确保军人家庭的安全。
家庭调解：
对于因家庭原因引起的不合格，可以尝试家庭调解，促进双方家庭和谐。
重新选择：
如果女方确实存在严重问题，无法满足军婚要求，军人可以选择重新寻找合适的对象。
请注意，以上信息仅供参考，具体操作应遵循当地法律和规定。如果还有其他问题或需要进一步的帮助，请咨询专业律师或相关部门