当您的车辆因违章被扣12分时，您需要按照以下步骤处理：
参加满分教育：
您需要在15日内到机动车驾驶证核发地或违法行为地的公安机关交通管理部门参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。
参加考试：
完成学习后，车辆管理所会在20日内安排您进行道路交通安全法律、法规和相关知识的考试。
缴纳罚款：
在参加学习和考试之前，您需要缴纳相应的罚款。
考试合格：
考试合格后，记分将被清除，并会发还您的机动车驾驶证。
考试不合格：
如果考试不合格，您需要继续参加学习和考试，直到合格为止。
拒不参加或不接受考试：
如果您拒不参加学习或考试，公安机关交通管理部门可能会公告您的机动车驾驶证停止使用。
请注意，如果您的驾驶证是大型客车、牵引车、城市公交车、中型客车、大型货车驾驶证，在一个记分周期内有记满12分记录，车辆管理所将注销您的最高准驾车型驾驶资格，并在三十日内办理降级换证业务。