在处理工程量清单漏项问题时，可以采取以下步骤：
审查合同条款
检查合同中是否有关于漏项处理的条款，例如漏项金额达到一定数额是否允许增补，或者双方如何协商处理漏项。
如果合同中有明确约定，按照合同约定执行。如果合同中没有约定，双方应通过协商达成一致意见。
确认责任归属
确定漏项是由建设方、施工方还是其他原因造成的。如果是建设方提供的信息不全或错误，建设方应承担责任。
如果是施工方编制工程量清单时的失误，施工方可能需要自行承担损失，除非漏项是由于招标方提供的信息不全或错误导致的。
及时沟通与协商
一旦发现漏项，施工方应及时以书面形式告知建设方，并提供相关证据和理由。
双方应尽快进行沟通，明确漏项的处理方式，包括增补、调整合同价款或解除合同等。
依据招标文件和相关文件处理
审查招标文件，确认漏项是否在承包范围内，以及是否可以通过补充协议或设计变更来解决。
如果漏项是由于图纸不明确或模糊引起的，可以要求设计单位进行澄清或完善，并相应调整工程量清单和合同价款。
遵循法律法规
根据《建设工程工程量清单计价规范》（GB50500-2013）等相关法律法规，处理漏项问题，确保合法合规。
记录与文档
详细记录漏项的发现过程、处理过程和结果，确保所有相关文件都有据可查，便于后续可能出现的争议解决。
通过以上步骤，可以有效地管理和解决工程量清单漏项问题，减少因漏项带来的风险和损失。