处理有扣分的违章通常需要遵循以下步骤：
准备材料：
携带身份证、驾驶证和行驶证到当地交警大队或车管所。
查询违章记录：
请求工作人员查询驾驶证分数和车辆的具体违章记录。
确认违章处理：
确认违章记录无误后，处理违章并获取交通违章缴款单。
缴纳罚款：
根据缴款单上的金额，在指定银行完成罚款的缴纳。
保留票据：
交完罚款后，保留好票据，以备后续查询违法信息或处理其他事宜。
请注意以下事项：
必须在收到罚款的行政处罚决定书之日起十五日内缴纳罚款，否则可能会产生滞纳金。
如果驾驶证扣分达到12分，可能需要参加道路交通安全法律、法规的学习并接受考试。
违章罚款应当开具财政部门统一制发的罚款收据，否则有权拒绝缴纳罚款。
违章处理后，违法信息通常会在一定时间内从系统中清除。