在离婚案件中，有两个孩子的抚养权判决通常遵循以下原则：
孩子的年龄
两周岁以下的子女，一般随母亲生活，除非母亲存在不适宜抚养的情况。
两周岁至八周岁的子女，父母双方可以协商决定，协商不成时，法院根据最有利于未成年子女的原则判决。
八周岁以上的子女，法院会尊重孩子的真实意愿，并结合其他因素进行综合判断。
抚养能力
法院会评估双方的经济条件、居住环境、教育水平等，以确定哪一方更有能力照顾孩子。
孩子的意愿
对于八周岁以上的孩子，法院会充分听取他们的意见。
特殊情况
如果两个孩子年龄较小，可能都随母亲生活，除非母亲有不适合抚养孩子的情况。
如果一方的抚养条件明显优于另一方，或者一方存在不适合抚养孩子的情况，抚养权可能判给条件更好的一方。
双方协商
如果父母双方能够就抚养权问题协商一致，可以按照双方的约定进行处理。
其他因素
包括家庭成员的健康状况、是否有时间陪伴孩子等。
最终，法院会根据双方的具体情况以及孩子的实际需要，作出最有利于未成年子女的判决。需要注意的是，法律随时间发展，具体判决可能会有所变化，请以最新的法律法规为准。