办理房产证滞纳金的计算方式如下：
滞纳金比例
契税滞纳金按日加收滞纳税款的万分之五。
计算起始日期
纳税人进行纳税申报的，征收机关核定的税款缴纳期限届满的次日为计算滞纳金的起始日期。
纳税人未进行纳税申报的，其取得土地房屋权属证明的次日为滞纳金计算的起始日期。
计算方式
滞纳金从滞纳税款之日起按日计算，直到税款全部缴纳完毕为止。
法律依据
《税收征收管理法》第三十二条规定，纳税人未按照规定期限缴纳税款的，税务机关除责令限期缴纳外，从滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。
《中华人民共和国契税暂行条例》规定了契税的税率和滞纳金的计算方法，即从滞交税款之日起，按日加收滞纳金，滞纳金的比例为万分之五。
建议
纳税人应严格按照规定的期限缴纳契税，以避免产生不必要的滞纳金。
若因特殊原因无法按时缴纳契税，应及时与税务机关沟通，了解延期缴纳的具体条件和手续。