根据提供的信息，从函馆到东京的交通费用如下：
1. 乘坐飞机：
ANA函馆到东京的机票大约为10000日币（约合人民币600元左右）。
2. 乘坐铁路：
使用JR Pass，从北海道到东京的费用大约为1800人民币左右，具体取决于购买的Pass类型和有效期。
如果不使用JR Pass，从函馆乘坐特急列车到新千岁机场，然后转乘地铁到东京品川，全程大约需要5小时48分钟。
另外，根据2016年的信息，乘坐JR特急百鸟号从函馆到东京品川的费用大约是18000日元（约合人民币1080元左右）。
请注意，以上信息可能随时间和政策变化而有所不同，建议在出行前核实最新的票价信息