商铺产权满40年后，根据中国现行的法律规定，您有以下几种选择：
申请续期
商铺所有人可以在产权到期前一年向政府提出续期申请。
续期时，需要按照政府规定的程序支付相应的续期费用，费用可能根据商铺总价值的一定比例收取。
续期成功后，您可以继续拥有商铺的产权。
国家收回并给予补偿
如果国家有拆迁计划或其他规划需要收回土地和地上建筑物，您可能需要无偿交还土地。
但国家会对地上建筑物进行作价补偿，补偿标准因地区而异，商业用地的补偿通常高于住宅用地。
注意事项
无论选择哪种方式，都应在产权到期前与政府或相关部门沟通协商，确保权益得到保障。
了解并遵循政府的续期政策和补偿标准，按规定的程序和要求进行申请或交还土地。
保留相关证件和文件，以便在处理产权问题时提供必要的证明材料。
请注意，以上信息基于我知识截止日期前的法律规定，具体政策可能会有所变动。建议咨询当地国土资源部门或专业律师获取最新信息