在结婚证被男方拿走的情况下，您可以通过以下步骤进行离婚程序：
补领结婚证
您可以携带户口簿和身份证，向原办理婚姻登记的机关或者一方常住户口所在地的婚姻登记机关申请补领结婚证。
婚姻登记机关在查证婚姻登记档案无误后，会为您补发结婚证。
协议离婚
补领结婚证后，如果双方对离婚事宜达成一致，可以到原办理婚姻登记的机关或者一方常住户口所在地的婚姻登记机关办理协议离婚。
诉讼离婚
如果无法达成一致，或者另一方不配合补领结婚证，您可以携带户口簿、身份证和婚姻登记机关出具的婚姻关系证明，到人民法院提起离婚诉讼。
在法院，您需要提交起诉状，其中应包含原告和被告的基本信息、诉讼请求、事实与理由以及相关证据。
法院在受理案件后，会进行调解；如果感情确已破裂且调解无效，法院将准予离婚。
请根据您的具体情况选择合适的离婚途径。