在日本使用银行卡取现，手续费的计算方式通常如下：
银联卡
手续费一般为取现金额的1%加上固定费用（如12元人民币），最低收费可能有所不同。
例如，工商银行、建设银行和中国银行在日本取现的手续费为取现金额1%加12元。
国际信用卡 （如Visa、MasterCard）：
手续费通常在3%-5%之间，最低收费可能在1000-2000日元之间。
地方银行
手续费可能因银行而异，建议提前查询或直接咨询银行。
其他注意事项
每年每个人名义的银行卡在日本取现最多可达10万元人民币等值。
某些银行可能针对较大额度的取款收取额外手续费。
查询银行卡余额在日本某些地方可能也需要收费。
建议在取款前，通过官方渠道或直接咨询发卡银行，获取最新的手续费信息，以免发生超额费用。需要注意的是，以上信息可能会随时间变化，请以最新公布的数据为准