在科目二考试中，如果出现超时情况，根据最新的驾考规定，会有以下处理：
倒车入库：
需要在210秒之内完成，否则将判为不合格。
侧方停车：
完成时间超过90秒，不合格。
打转向：
打转向的时间需要大于三秒钟，否则不合格。
其他操作：
如视线离开行驶方向超过2秒，或10秒内未完成起步，也将判为不合格。
科目二考试满分为100分，80分为合格标准。如果考试中出现超时，将扣除100分，即考试不合格。根据规定，不合格的情况下，考生有一次免费补考机会，如果补考仍然不通过，则终止本次考试。
请确保在考试中严格控制时间，避免超时扣分。