当发票作废操作出现错误时，可以采取以下步骤进行处理：
撤销作废
如果发票作废操作尚未完成，可以立即在税控系统中撤销不符合要求的作废操作。
重新开具发票
根据发票类型，重新开具新的发票票据，并确保其合法有效性。
如果是当月发现的错误，可以直接在税控系统中作废并重新开具新发票。
如果是跨月错误，需要开具红字发票，并在账务处理时红冲原先的收入。
备案处理
将新的发票票据和作废的发票票据一同提交至财政部门备案，确保票据的准确性和真实性。
避免处罚
注意，发票作废错误可能会受到税收处罚，因此在作废过程中应进行严格审查，确保按照相关规定正确执行。
特殊情况处理
如果发票已经被对方认证，需要购货方取得当地主管税务机关的进货退出或索取折让证明单，销售方再根据此证明重新开具发票。
对于电子专用发票，如果金额填写错误，不能直接作废重开，需要先开具红字电子专票处理后，再按正确金额重新开具蓝字电子专票。
文档保存
保留所有作废和重新开具的发票副本，以备税务机关查验。
请根据具体情况选择合适的处理方式，并确保所有操作符合当地税务机关的规定和要求