处理车违章扣分的方法如下：
携带证件前往违章处理大厅
携带身份证、驾驶证和行驶证，前往当地交警大队或违章处理大厅办理违章业务。
查询违章记录
在车管所或交警大队查询违章记录，包括违章次数、扣除的分数以及罚款金额。
确认并处理违章
在违章处理窗口确认违章记录无误后，工作人员会开具违章处罚决定书。
缴纳罚款
根据处罚决定书上的金额，在指定的银行完成罚款的缴纳。缴纳罚款后，务必保留好票据。
处理滞纳金
处罚决定书一旦打印完毕，必须在15日内交罚款。超过15天的，每天收取3%的滞纳金，但滞纳金的总额不能超过罚款的总额。
网络处理
扣分在3分以下的违法行为可以在交管系统网上处理，扣分在3分以上的违法行为需要到交管局违法处理窗口打印处罚决定书，再进行扣分处理和缴纳罚款。
异地违章处理
如果是异地违章扣分，且达到12分，很多地方要求车主前往违章地处理，处理过程可能较为不便。
建议：
尽早处理违章记录，避免超过15天的缴纳期限，以免产生滞纳金。
可以选择网上处理或到违章处理大厅办理，根据违章的严重程度选择最合适的方式。