当档案不完整时，您可以按照以下步骤进行处理：
联系原档案保管单位
请求他们协助补全档案或出具相关证明。
收集证明材料
找到档案中有记录的相关单位，并请求他们开具证明，加盖公章。
如果档案中缺少关键资料，如学历证明、重要时期表现等，应向有关部门或学校核实查询，并提供书面证明。
补办缺失资料
对于高中、大学或自考等教育阶段的档案，联系毕业院校补办相关登记表、成绩表等材料，并由相关老师签字盖章。
法律途径
如果遇到档案保管单位不配合的情况，可以使用法律手段解决。
养老保险缴纳年限
在办理退休时，可以申请以实际养老保险缴纳年限计算养老金发放标准，放弃档案中记录的视同缴纳年限部分。
档案转入有管理权限的单位
补办或收集齐全的资料后，通过机要通道将档案转入具有档案管理权限的单位，如人才中心、国企、事业单位等。
注意档案的完整性
确保所有补办或收集的资料齐全，并正确装袋密封，加盖公章。
请根据您的具体情况选择合适的处理方式。