当党员档案丢失时，处理流程通常包括以下几个步骤：
确认党员身份
党支部需通过调查核实，确认党员身份的真实性。
可能需要派人前往入党地调查或通过函调等方式进行核实。
收集证明材料
准备能证明党员身份的相关材料，如组织关系介绍信、接转证明等。
收集党员身份证明、政治表现证明、学习经历证明等。
补办手续
由现所在党支部负责补办《入党志愿书》。
在《入党志愿书》封面上注明补办日期，并加盖公章。
补办人填写《入党志愿书》的相关栏目。
上报审核
将补办好的《入党志愿书》及相关证明材料报上级党组织审核。
审核通过后，将材料存入本人档案。
补办其他材料 （如适用）：
对于其他丢失的入党关键性材料，根据具体情况补办。
对于50周岁及以上农村党员，若关键材料丢失，在现工作单位党组织核实身份后，可不再补办。
补办过程中的注意事项
补办的材料必须真实可靠，与实际情况相符。
补办的材料需要加盖公章或者签字确认。
补办的材料需要进行归档保存，方便后续查询和使用。
请注意，补办流程可能因地区和具体情况而有所不同，建议联系当地党组织获取详细信息。