当您在餐饮店发现食品中有苍蝇时，可以采取以下措施来处理这个问题：
保留证据
确保不要将含有苍蝇的食品端走，以便保留证据。
可以通过录音录像等方式记录下发现苍蝇的过程。
与商家协商
向商家提出合理的赔偿要求，如赔偿商品价格的十倍或在损失基础上追加三倍赔偿。
消费者协会或调解组织
请求消费者协会或依法成立的其他调解组织介入调解。
投诉举报
向相关的行政管理部门进行投诉举报。
法律途径
如果协商无果，可以根据与商家之间的仲裁协议申请仲裁，或向人民法院提起诉讼。
饭店环境卫生
保持饭店内部，特别是厨房的清洁卫生，定期清理食物残渣和垃圾。
食材应密封保存，使用防蝇罩或保鲜膜覆盖。
物理防治
安装纱门纱窗，使用灭蝇灯、粘蝇纸等物理方法来诱捕苍蝇。
消毒杀菌
定期对食堂进行消毒，使用有效的消毒剂消灭苍蝇的卵和幼虫。
通风换气
保持食堂内良好的通风，降低湿度，减少苍蝇滋生的环境条件。
员工培训
对食堂工作人员进行卫生培训，提高他们的卫生意识。
采取以上措施可以有效地解决餐饮店苍蝇问题，并保障消费者的合法权益