新生儿参加新型农村合作医疗（新农合）的报销流程通常包括以下几个步骤：
办理户籍登记 ：首先给新生儿取名并办理户籍登记。参保登记：
携带户口簿和监护人身份证原件到户籍所在乡镇（街道）办理城乡居民医保参保登记。
缴费：
根据缴费通知单到指定银行缴费。
办理市民卡：
户籍登记满15日后，监护人可到制卡中心办理市民卡。
报销
若已办理参保登记，出院时直接刷卡报销。
若未办理参保登记，出院后到当地公共服务中心办理参保登记并缴费，然后去社保经办机构申请报销。
特殊情况
如果在异地住院，需要提前办理异地住院转诊手续，并在出院后携带相关证明材料到新农合部门报销。
对于出生3个月内申报登记并缴费的新生儿，之前发生的医疗费用也可报销。
请注意，报销比例和条件可能因地区而异，具体详情建议咨询当地医保部门