处理超占宅基地的问题，通常有以下几种方式：
退还超出部分
超出批准面积的宅基地应当退还给村集体。
如果宅基地面积超标，多占的土地以非法占用土地论处。
有偿使用
在部分地区，超占部分可以按宅基地有偿使用政策缴纳费用。
费用的具体数额通常与超占面积成正比。
强制收回
对于未经批准或通过欺骗手段获得宅基地的情况，政府可责令退还并拆除违建。
对于无人居住或无人继承的宅基地，村集体可无条件收回。
暂时保留
在某些情况下，如拆除后可能影响居住安全或公共利益，超占部分可能会被暂时保留。
宅田相抵
使用耕地来弥补超占的宅基地面积，以保持土地总量的平衡。
村民自治协商
村集体可共同商定处理方案，如通过协商、缴费补偿等方式，并上报上级部门批准。
法律依据
《土地管理法》规定，农村村民一户只能拥有一处宅基地，面积不得超过当地规定的标准。
处理超占宅基地时，应考虑实际情况，并遵循当地政策和法规。