摩托车驾驶证被扣分后的处理流程如下：
不满12分
缴清相应的罚款后，记分会被清除。
满12分
驾驶人需要在15日内到机动车驾驶证核发地或违法行为地的公安机关交通管理部门参加为期7天的道路交通安全法律、法规及相关知识的学习。
学习结束后，需参加考试，考试合格后，记分被清除，并返还驾驶证；不合格则需继续学习和考试。
若拒不参加学习或考试，驾驶证可能会被公安机关交通管理部门公告停止使用。
特殊情况
如果驾驶时没有行驶证，摩托车可能会被扣留，需补办行驶证并缴纳罚款，同时可能会扣除12分。
处理途径
可以选择线上处理，通过官方平台缴款扣分，但可能受限于网络和复杂问题处理。
也可以选择线下处理，到指定窗口咨询并解决问题，可能需要排队等待。
罚款项
不同违章行为有不同的罚款金额，例如超载、超速、不按规定安装号牌等。
“极刑”
严重违章行为，如无证驾驶、驾驶报废车辆、驾驶拼装车辆、无号牌驾驶、故意遮挡或污损号牌等，可能会面临吊销驾驶证、罚款甚至拘留等严厉处罚。
请根据具体情况选择合适的处理方式，并确保在规定的时间内完成相关手续，以免产生不必要的滞纳金或其他法律后果。