处理电子眼违章扣分罚款的方法如下：
确认违章行为
确认违章行为，并收到交管部门发送的短信通知，了解违章详情。
前往交警大队或在线处理
可以前往当地交警大队的处罚教育室窗口接受处理，处理完毕后到指定银行缴纳罚款。
或者通过交管12123平台在线处理，适用于罚款200元以下、非现场执法的违章，且扣分累计未达12分的情况。
携带证件
处理违章时需携带本人驾驶证、行驶证、身份证。
缴纳罚款
可以在交警大队指定的银行缴纳罚款，或者利用自助缴费机、网上银行等方式缴纳。
对于需要扣分的违章，必须先确认违章并扣除分数后才能缴纳罚款。
注意时限
收到《交通违法行为处罚决定书》后，应在15天内缴纳罚款，否则会产生滞纳金。
滞纳金计算
滞纳金通常按照罚款金额的3%计算，直至滞纳金等于罚款金额或车主缴纳罚款为止。
请确保在规定时限内处理违章，以免产生额外费用。