当两个人共同使用公积金进行贷款还款时，扣款方式通常如下：
从主扣款账户开始扣款：
系统首先会从设定的主扣款人（通常是主贷人）的公积金账户中扣除应还贷款本息。
次扣款账户：
如果主扣款账户的余额不足以支付当月应还贷款本息，系统会从另一个人的公积金账户中继续扣除余额。
储蓄账户：
如果夫妻双方公积金账户余额累计仍然不足以偿还当月应还贷款本息，那么借款人需要在每月还款日前向指定的储蓄账户存入足够资金，由银行直接从中扣除。
提取公积金还款：
在某些情况下，夫妻双方也可以选择每年提取两人的公积金账户余额来还款。
请确保在每月还款日前，账户中有足够的资金或已设置自动转账，以避免逾期还款。