入职合同中的违约金计算主要依据《中华人民共和国劳动合同法》第二十二条和第二十三条的规定。具体计算方式如下：
违反服务期约定的违约金
劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。
用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
违反竞业限制约定的违约金
对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。
劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
示例计算
假设用人单位为劳动者提供了10万元的培训费用，并约定了5年的服务期。如果劳动者在服务期未满时离职，需要支付违约金。
培训费用分摊
总培训费用：10万元
服务期限：5年
每年分摊的培训费用：10万元 ÷ 5年 = 2万元/年
违约金计算
劳动者服务了1年后离职，尚未履行的服务期限为4年。
违约金 = 培训费用 × （未履行服务期限 ÷ 服务期限） × 100%
违约金 = 10万元 × （4年 ÷ 5年） × 100% = 8万元
因此，劳动者需要支付8万元的违约金。
建议
用人单位和劳动者在签订劳动合同时，应明确约定违约金的数额和计算方式，以确保双方权益的合法性和公平性。
如果约定的违约金数额过高或过低，可以根据《劳动合同法》的相关规定，申请法院或仲裁机构进行调整。
希望以上信息对您有所帮助。