办理货运通行证的流程如下：
准备申请材料
《道路货物运输经营申请表》；
企业章程文本；
投资人、负责人身份证明及其复印件，经办人的身份证明及其复印件和委托书；
安全生产管理制度文本；
拟投入车辆承诺书，包括客车数量、类型及等级、技术等级、座位数以及客车外廓长、宽、高等；
已聘用或者拟聘用驾驶人员的驾驶证和从业资格证及其复印件；
机动车行驶证原件及复印件；
汽车交通事故责任强制保险单的原件和复印件；
机动车驾驶证；
身份证原件及复印件；
非本地驾驶员另需提供暂住证原件复印件；
房产证明、停车位证明（针对市区单位和居民办理年度通行证）；
营业执照复印件（针对个体工商户）。
提交申请
携带上述材料到市交巡警支队秩序科办证窗口或当地交警管理支队办事大厅提交申请。
或通过交管12123手机应用进行在线申请。
审核与审批
材料审核通过后，发放《行政许可受理通知书》。
汇总申请材料并进行审批。
审批通过后，发放道路运输经营许可证及货车通行证。
注意事项
申请车辆必须无道路交通安全违法行为未接受处理记录，且在申请前六个月内无超载、超速等严重道路交通安全违法行为，按期年检非假套牌。
具备在禁行路段上通行的必要性，即除禁行路段外无其他路线可行。
车辆合法，按期审验并无交通违法行为未处理。
建议提前准备好所有相关材料，并根据所在地区的要求选择合适的办理方式，以确保顺利办理货车通行证。