处理A2驾驶证扣3分的流程如下：
携带证件：
携带身份证、驾驶证和行驶证到违章处理大厅或车管所办理业务。
确认违章记录：
将证件交给工作人员，工作人员会调出你的违章记录，确认无误后，工作人员会打印处罚决定书。
缴纳罚款：
持处罚决定书和相关证件到指定银行缴纳罚款，并保留好票据。
查询违章信息：
过几日后，可以使用交管12123平台或其他方式查询违章信息，确认违章信息是否消失。如果违章信息未消失，可以携带票据到违章大厅进行查询和处理。
需要注意的是，如果在一个记分周期内未处理违章记分，记分会转入下一个记分周期。此外，A2驾驶证在扣减3分后，驾驶员需要在本记分周期结束前接受审核驾驶证，并提交首套健康证明。
建议尽快处理违章记录，以免影响驾驶证的正常使用。