如果三方协议上的章盖错了，您可以采取以下步骤进行处理：
重新复印并盖章
向学校请求重新复印一份新的三方协议。
在复印件上重新盖章。
补正并盖章
如果错误不影响协议主体身份的明确性，您可以在协议旁边的空白处重新盖章。
确保两个章不重合，且盖章位置正确。
协商解决
与对方（即用人单位和毕业生）协商，商定修改方式和时间。
及时修改和补正协议内容。
保存证据
在修改和补正过程中，保存好相关证据，如修改前后的协议、协商记录等。
注意协议有效性
确保修改后的协议内容与原协议保持一致，并注明修改的时间和原因。
如果无法重新签署协议，补正内容应准确、清晰，并注明补正的时间和原因。
以上步骤可以帮助您解决三方协议盖章错误的问题。