人力资源部门在计算员工工资时，通常会遵循以下步骤：
收集数据
收集员工的工时、绩效、奖金、加班记录、缺勤情况等相关数据。
计算基础工资
根据员工的职位级别、工作绩效、工作经验等因素，结合市场行情和公司财务状况，确定基本工资。
计算加班工资
根据员工的加班记录，按照法定标准计算平时加班和周末加班的工资。
计算浮动工资
包括绩效考核工资和计件工资等，根据员工的绩效考核结果和完成的工作量计算。
扣除法定款项
扣除员工的所得税、社会保险、住房公积金和其他法定扣款。
计算净工资
将基本工资、加班费、奖金和其他补贴等收入减去各项扣款，得到员工的净工资。
工资发放
通过银行转账或现金方式将净工资发放给员工。
工资条制作
可以采用引用法、排序法、插入空行法、公式法等方法制作工资条，确保信息准确无误。
薪酬管理
设计合理的薪酬结构，确保薪酬对内公平、对外具有竞争力，并易于管理者操作。
薪酬调整
根据市场变化、生活指数调整、公司业绩和员工绩效等因素，定期或不定期调整员工薪酬。
请注意，具体的工资计算方法可能因公司政策、行业标准和地区法律法规而有所不同。人力资源部门应确保所有操作符合相关法规，并与财务部门紧密合作，确保工资计算的准确性和合规性