公司缴纳住房公积金的流程通常包括以下几个步骤：
缴存登记：
新设立的单位或录用新职工的单位，应在设立或录用之日起30日内，到当地住房公积金管理中心办理缴存登记，并为职工办理住房公积金账户设立手续。
填写汇缴书：
单位专管员每月按期填写《住房公积金汇缴书》一式二份，送达至柜台受托银行窗口。
审核与汇缴：
窗口受托银行审核同意后办理汇缴，并出具《住房公积金汇缴书》回单联，作为单位缴款的财务凭证。
缴纳比例与基数：
单位与职工个人按照一定比例缴存，比例通常为职工上一年度月平均工资的一定百分比（如5%-12%），具体比例和基数根据地方政策确定。
代扣代缴：
单位从职工工资中代扣代缴个人部分的公积金，并将单位与职工部分的公积金汇缴到住房公积金专户。
记录管理：
住房公积金管理中心为每位职工建立明细账，记录职工的缴存、提取等情况。
请注意，以上流程可能因地区政策不同而有所差异，具体操作应遵循当地住房公积金管理中心的规定。