在上海办理健康证的流程如下：
准备材料
携带身份证和个人免冠一寸照片二张。
领取体检表和培训学习卡
到所在地的疾控中心健康体检领取体检表和培训学习卡，填写好姓名、性别等基本情况。
体检
完成体检，体检可以在疾控中心进行，也可以由疾控中心指定的医院进行。体检项目通常包括肝功能、胸透、乙肝两对半等。
参加卫生知识培训和考核
参加由卫生监督机构组织的卫生法律法规知识培训，培训合格后发放健康证。
领取健康证
体检和培训合格者，由疾病预防控制中心体检科发放健康证。
注意事项
办理健康证前需要进行健康查体，包括采血、大便肛拭化验、内外科常规体检、X光胸透等。
体检结果符合发放健康证条件的，经卫生监督机构组织的卫生法律法规知识培训合格后，发放健康证。不符合条件的，不予办理健康证。
建议提前联系所在地的疾控中心或指定医院，了解具体的体检时间和培训安排，以确保顺利办理健康证。