发现公司偷税的方法主要有以下几种：
税务机关调查
举报线索：税务机关可以根据举报人提供的线索，调查公司的偷税漏税情况。
稽查上下游企业：通过稽查公司上下游的企业，连带查出公司的偷税漏税事实。
分析涉税指标：通过分析公司的涉税指标，如异常指标值、长期零申报或报亏损等，查出公司的偷税漏税行为。
公司财务数据分析
财务报表：查看公司的财务报表，了解公司的营业收入、利润、成本等数据，如果数据与实际经营情况不符，可能存在偷税漏税行为。
纳税记录和申报情况：通过查看公司的纳税记录、纳税申报情况、税务审核情况等数据，了解公司是否存在漏税或虚开发票等行为。
公司经营情况了解
经营活动：了解公司的经营活动、采购和销售情况等，判断公司的实际运营情况是否与财务报表相符。
公司治理情况：了解公司的内部管理、财务制度等情况，判断是否存在内部控制缺失等问题。
发票和账簿检查
发票金额检验：根据国家规定的企业增值税的计算公式检验发票金额，核查是否存在伪造、变造、隐匿、擅自销毁账簿和记账凭证等行为。
虚假纳税申报：检查企业是否存在虚假的纳税申报行为，如明销暗记、不列或少列收入等。
系统比对
税务系统：税务机关利用税务系统可以查到偷税漏税行为，如通过近金税三期系统分析企业的各类报表信息，找出税务疑点。
其他手段
举报：消费者、员工、竞争对手等可以通过电话、信件、网站等方式举报公司的偷税漏税行为。
综上所述，发现公司偷税需要综合运用多种手段，包括举报、稽查、数据分析、账簿检查等。如果您发现公司存在偷税漏税行为，建议及时向税务机关举报，以便尽快采取措施进行调查和处理。