小规模企业开具增值税专用发票的方法如下：
自行开具
条件：所有增值税小规模纳税人（其他个人除外）均可以使用增值税发票管理系统自行开具增值税专用发票。特定行业的小规模纳税人在销售额等方面有相应要求。
流程：
登录税务局网上办税系统（如电子税务局）。
填写开票信息，包括购买方的纳税人识别号、名称、发票类型等。
填写商品或服务信息，如名称、规格型号、数量、单价等。
核对信息并确认开票。
系统自动生成发票号码，并锁定在税务局数据库中。
打印或发送电子发票给购买方。
申请税务机关代开
条件：如果小规模纳税人不满足自行开具专票的条件，或者选择不自行开具专票，可以向主管税务机关申请代开增值税专用发票。
流程：
向主管税务机关提出书面申请，并提供相关证明材料，如购货合同、进货凭证等。
税务机关审核通过后，根据纳税人提供的信息开具增值税专用发票。
纳税人需要当场缴纳相应的增值税税款及附加税费。
建议
自行开具：适合具备自行开具专票条件的小规模纳税人，可以节省时间和精力，确保发票信息的真实性和准确性。
申请代开：适合不满足自行开具条件的小规模纳税人，虽然需要提供额外材料，但可以由税务机关代为处理，减轻纳税人负担。
小规模纳税人在开具增值税专用发票时，应严格遵守相关税法和开票规定，确保发票的真实性、合规性和合法性，避免违反税法规定带来的法律后果。同时，需妥善管理开具的专票，并按照税法规定的时限保存相关发票和开票记录，以备税务机关的审查和核对。