在离婚案件中，对于有两个孩子的抚养权分配，通常情况下，法院会考虑以下因素来决定抚养权的归属：
孩子的年龄和性别
不满2周岁的孩子，一般由母亲直接抚养。
两周岁到八周岁的孩子，法院会综合考虑双方父母的抚养能力、条件以及孩子的意愿等因素来决定。
八周岁以上的孩子，法院会尊重其真实意愿。
父母的抚养能力和条件
包括经济收入、居住环境、教育资源、工作稳定性、时间精力等。
孩子的意愿
对于八周岁以上的孩子，法院会充分听取他们的意见。
协商一致
父母双方可以通过协商来决定每个孩子的抚养权归属。
法院判决
如果协商不成，法院将根据上述因素，按照最有利于未成年子女的原则判决。
抚养费
未直接抚养孩子的一方应支付抚养费，具体数额根据孩子实际需要、父母双方负担能力和当地生活水平确定。
以上是抚养权分配的一般原则。每个案件都有其独特性，法院会根据具体情况作出判决。如果需要更详细的法律咨询，建议联系专业律师