员工工资个人所得税的计算遵循以下步骤和公式：
确定应纳税所得额
应纳税所得额 = 月度收入 - 个税起征点（5000元）- 专项扣除（三险一金等）- 专项附加扣除 - 其他依法确定的扣除。
应用超额累进税率
根据《个人所得税法》规定，工资薪金所得适用超额累进税率。
税率表分为7级，税率从3%至45%不等，速算扣除数随税率级距变化。
计算应纳税额
应纳个人所得税税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数。
计算实发工资
实发工资 = 应发工资 - 五险一金 - 应纳个人所得税税额。
举个例子，如果一个员工的月收入为10000元，扣除五险一金后剩余8000元，专项扣除和专项附加扣除合计1000元，那么：
应纳税所得额 = 8000元 - 5000元 - 1000元 = 2000元
应纳个人所得税税额 = 2000元 × 3% - 0元 = 60元
实发工资 = 10000元 - 五险一金 - 60元 = 9940元
请注意，税法可能会有更新，具体计算时应参考最新的税法规定和相关政策。