办理港澳通行证的流程如下：
选择办理地点
可以在市内本人户籍地、工作地和居住地任意选择最便利的公安出入境管理部门出国（境）证件受理点提出申请并递交申请材料。
首次申请所需材料
《中国公民出入境证件申请表》。
标准照片1张及出入境证件照片检测采集回执单。
身份证原件（未满16周岁公民除外）。
未满16周岁公民还需提交身份证原件或户口本、监护证明（如出生证明、户口本等）及一方监护人的身份证原件及复印件。
监护人无法陪同的，提交监护人委托书及陪同人的身份证或护照等身份证明及复印件。
属于登记备案的国家工作人员、现役军人需提交单位或上级主管单位出具的同意办理港澳通行证的证明。
按规定提交或核验指纹信息。
公安机关认为应提交的其他证明材料。
再次申请所需材料
填写完整的申请表，贴上照片。
交回申请人持有的有效《内地居民往来港澳通行证》。
属于登记备案的国家工作人员和驻渝部队的军人、武警，每次申请均需提交单位或上级主管单位出具的同意办理出入境的函。
办理流程
申请人本人亲自到当地公安分局出入境办证大厅办理，不能委托他人代办。
到达办证大厅后，首先到咨询台咨询续签流程，然后领取申请表，完成填写后领号排队，到办理窗口提交申请材料，并领取回执单。
凭回执单在办理窗口领取缴费收据，然后到银行进行缴费，缴完费用后记得要将缴费单据收好，因为领证时需要同时出示缴费单据和回执单。
续签办理的日期一般为10个工作日，所以并不一定能当日办理当日领证，需要等待办理机构的通知。
异地办理
异地办理港澳通行证需要携带相关材料前往所在地公安局出入境管理部门申请办理，一般材料包括：身份证及户口本原件及复印件、高等院校在读的学生需提供加盖学校公章的证明及学生证、就业人员需提供有效居住证及社保证明。
建议提前了解当地出入境管理部门的具体要求和流程，以确保顺利办理港澳通行证。