当车辆事故中双方负同等责任时，保险公司的赔偿方式如下：
交强险赔偿：
首先通过机动车第三者责任强制保险（交强险）进行赔偿，交强险会先行赔付，不考虑责任比例。
超出部分赔偿：
如果交强险的赔偿不足以覆盖全部损失，那么超出部分将根据事故责任比例进行分担。对于机动车之间的事故，双方各承担50%的责任。
商业险赔偿：
如果事故双方都有购买商业险，那么超出交强险赔偿限额的部分，可以根据各自购买的险种和保险合同中的条款，由相应的保险公司进行赔偿。
其他损失：
如果事故造成人身伤亡或财产损失，根据《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律规定，保险公司还应在责任限额范围内进行赔偿。
需要注意的是，保险公司在赔偿时，会按照事故责任比例和保险条款来确定最终的赔偿金额，如果有任何疑问，可以咨询专业律师或保险公司获取详细解释。